조특령§97의3⑤ 계산식의 분자, 분모가 모두 음수인 경우 임대기간 중에 발생한 양도차익
사전-2026-법규재산-0906기본 정보
47양도소득세장기임대주택조세특례임대주택세무조사세법소득세법특별공제
조특령§97의3⑤ 계산식의 분자, 분모가 모두 음수인 경우 임대기간 중에 발생한 양도차익
사전-2026-법규재산-0906
2026. 8. 10.
사전
양도
없음
판례·예규 요약(AI)
조세특례제한법 제97조의3에 따라 장기일반민간임대주택을 양도하는 경우, 임대기간 중 발생한 양도차익은 특정 계산식에 따라 산정된다. 이 계산식에서 분자와 분모가 모두 음수인 경우, 양도차익은 없는 것으로 간주된다.
AI 요약·해설 안내
본문의 요약·정리는 참고용이며 오류가 있을 수 있습니다. 실제 적용 여부는 사실관계·시점·관련 법령에 따라 달라질 수 있으므로, 원문과 최신 법령을 확인하시고 필요 시 세무 전문가에게 상담하시기 바랍니다.
판례·예규 내용
사실관계
2016년 5월에 주택(A)을 취득하여 준공공임대주택으로 등록하였다. 2024년 5월에 임대기간이 만료되어 임대주택이 자동으로 말소되었다. 2026년 5월에 주택(A)을 양도하였으며, 이때 임대기간 마지막 날 및 양도일 기준시가는 취득일 기준시가보다 낮지만 실거래가액은 높은 상황이다.
판결 이유
임대기간 중 발생한 양도차익은 조세특례제한법 제97조의3에 따라 계산되어야 하며, 이 경우 분자와 분모가 모두 음수인 경우에는 양도차익이 없다는 점을 강조하였다.
기관 입장
세무당국은 조세특례제한법 제97조의3의 적용 여부를 검토하고, 계산식의 분자와 분모가 모두 음수인 경우 양도차익이 없다고 판단하였다.
납세자 주장
조세특례제한법 제97조의3의 요건을 충족한 장기일반민간임대주택을 양도하는 경우, 조세특례제한법 시행령 제97조의3 제5항의 계산식에 따라 임대기간 중 발생한 양도차익이 없다고 주장하였다.
원문
요지
조특령§97의3⑤ 계산식의 분자, 분모가 모두 음수인 경우 임대기간 중에 발생한 양도차익은 없는 것임
답변내용
귀 사전답변 신청의 사실관계와 같이, 「조세특례제한법」(2022.12.31. 법률 제19199호로 개정되기 전의 것)제97조의3제1항이 적용되는 장기일반민간임대주택을 양도하는 경우로서
「조세특례제한법 시행령」제97조의3제5항 계산식의 분자(B-C)와 분모(D-E) 모두 음수인 경우 ‘임대기간 중에 발생한 양도차익’은 없는 것으로 보는 것입니다.
상세내용
PDF로 보기
상세내용 안에 있는 표나 도형 등이 제대로 표시가 되지 않을 경우... ?
1. 사실관계
○ ’16.05월 주택(A) 취득하여 준공공임대주택으로 등록
○ ’24.05월 임대기간 만료로 임대주택 자동말소
※ 조특법§97의3 따른 장기일반민간임대주택 요건을 갖춘 것으로 전제
○ ’26.05월 주택(A) 양도
※ 임대기간 마지막 날 및 양도일 기준시가는 취득(임대개시)일 기준시가 보다 낮지만 실거래가액은 높은 것을 전제
2. 질의내용
○ 舊조특법§97의3의 요건을 충족한 장기일반민간임대주택을 양도하는 경우로서,
-조특법§97의3 적용시 조특령§97의3⑤ 계산식의 분모와 분자가 모두 음수인 경우 임대기간 중에 발생한 양도차익 범위
전체 양도차익
×
임대기간 마지막 날 기준시가
-
임대기간 개시일 기준시가
양도일 기준시가
-
취득일 기준시가
3. 관련법령
□ 조세특례제한법(2022.12.31. 법률 제19199호로 개정된 것) 제97조의3 【장기일반민간임대주택등에 대한 양도소득세의 과세특례
① 대통령령으로 정하는 거주자가 「민간임대주택에 관한 특별법」제2조제2호에 따른 민간건설임대주택으로서 같은 조 제4호 또는 제5호에 따른 공공지원민간임대주택 또는 장기일반민간임대주택을 2027년 12월 31일까지 등록[2020년 7월 11일 이후 장기일반민간임대주택으로 등록 신청한 경우로서 「민간임대주택에 관한 특별법」(법률 제17482호로 개정되기 전의 것을 말한다) 제2조제6호에 따른 단기민간임대주택을 2020년 7월 11일 이후 같은 법 제5조제3항에 따라 공공지원민간임대주택 또는 장기일반민간임대주택으로 변경 신고한 주택은 제외한다]한 후 다음 각 호의 요건을 모두 갖추어 그 주택을 양도하는 경우 대통령령으로 정하는 바에 따라 임대기간 중 발생하는 양도소득에 대해서는 「소득세법」제95조제1항에 따른 장기보유 특별공제액을 계산할 때 같은 조 제2항에도 불구하고 100분의 70의 공제율을 적용한다.
1. 10년 이상 계속하여 임대한 후 양도하는 경우
2. 대통령령으로 정하는 임대보증금 또는 임대료 증액 제한 요건 등을 준수하는 경우
② 제1항에 따른 과세특례는 제97조의4에 따른 장기임대주택에 대한 양도소득세의 과세특례와 중복하여 적용하지 아니한다.
③ 제1항에 따라 과세특례를 적용받으려는 자는 대통령령으로 정하는 바에 따라 주택임대에 관한 사항을 신고하고 과세특례 적용의 신청을 하여야 한다.
④ 제1항에 따른 임대주택에 대한 임대기간의 계산과 그 밖에 필요한 사항은 대통령령으로 정한다.
부칙 <제19199호, 2022.12.31.>
제1조(시행일) 이 법은 2023년 1월 1일부터 시행한다. (이하 생략)
제38조(장기일반민간임대주택 등에 대한 양도소득세 과세특례에 관한 경과조치) 이 법 시행 전에 등록을 한 공공지원민간임대주택 또는 장기일반민간임대주택에 대한 양도소득세 과세특례에 관하여는 제97조의3제1항의 개정규정에도 불구하고 종전의 규정에 따른다.
□조세특례제한법(2022.12.31. 법률 제19199호로 개정되기 전의 것) 제97조의3 【장기일반민간임대주택 등에 대한 양도소득세의 과세특례】
①대통령령으로 정하는 거주자가 2020년 12월 31일(「민간임대주택에 관한 특별법」제2조제2호에 따른 민간건설임대주택의 경우에는 2022년 12월 31일)까지 「민간임대주택에 관한 특별법」제2조제4호에 따른 공공지원민간임대주택 또는 같은 법 제2조제5호에 따른 장기일반민간임대주택을 등록[2020년 7월 11일 이후 장기일반민간임대주택으로 등록 신청한 경우로서 아파트를 임대하는 민간매입임대주택이나 「민간임대주택에 관한 특별법」(법률 제17482호로 개정되기 전의 것을 말한다) 제2조제6호에 따른 단기민간임대주택을 2020년 7월 11일 이후 같은 법 제5조제3항에 따라 공공지원민간임대주택 또는 장기일반민간임대주택으로 변경 신고한 주택은 제외한다]하여 다음 각 호의 요건을 모두 갖춘 경우 그 주택(이하 이 조에서 “장기일반민간임대주택등”이라 한다)을 양도하는 경우에 대통령령으로 정하는 바에 따라 임대기간 중 발생하는 소득에 대해서는 「소득세법」제95조제1항에 따른 장기보유 특별공제액을 계산할 때 같은 조 제2항에도 불구하고 100분의 50의 공제율을 적용한다. 다만, 장기일반민간임대주택등을 10년 이상 계속하여 임대한 후 양도하는 경우에는 100분의 70의 공제율을 적용한다.
□조세특례제한법(2026.02.27. 대통령령 제36127호로 개정된 것) 시행령 제97조의3 【장기일반민간임대주택등에 대한 양도소득세의 과세특례】
⑤ 「소득세법」제95조제1항에 따른 장기보유 특별공제액을 계산할 때 법 제97조의3제1항에 따라 100분의 70의 공제율을 적용하는 경우에는 임대기간 중에 발생한 양도차익에 한정하여 적용하며, 임대기간 중 양도차익은 기준시가를 기준으로 다음 계산식에 따라 산정한다. 이 경우 새로운 기준시가가 고시되기 전에 취득 또는 양도하거나 제1항에 따른 임대기간의 마지막 날이 도래하는 경우에는 직전의 기준시가를 적용하여 계산한다. <개정 2026.2.27.>
A
×
B - C
D - E
A : 「소득세법」제92조제2항제1호에 따른 양도차익
B : 제2항에 따른 실제 임대기간의 마지막 날의 기준시가
C : 제2항에 따른 실제 임대기간의 개시일의 기준시가
D : 양도일의 기준시가
E : 취득일의 기준시가
□조세특례제한법(2021.02.17. 대통령령 제31444호로 개정된 것) 시행령 제97조의3 【장기일반민간임대주택등에 대한 양도소득세의 과세특례】
⑤ 「소득세법」 제95조제1항에 따른 장기보유 특별공제액을 계산할 때 법 제97조의3제1항 본문에 따른 100분의 50의 공제율 또는 같은 항 단서에 따른 100분의 70의 공제율을 적용할 때에는 임대기간 중에 발생한 양도차익에 한정하여 적용하며, 임대기간 중 양도차익은 기준시가를 기준으로 산정한다. <신설 2021.2.17.>
※ 개정취지 : 임대주택 특례 제도 정비 및 관련 조문 명확화
부칙 <제31444호, 2021.2.17.>
제1조(시행일) 이 영은 공포한 날부터 시행한다. (이하 생략)
제2조(일반적 적용례) ② 이 영 중 양도소득세 및 증권거래세에 관한 개정규정은 이 영 시행 이후 양도하는 분부터 적용한다.
문서 길이: 3,439자원본 문서에서 보기
판시사항 및 쟁점
판시사항
- •임대기간 중 발생한 양도차익은 계산식에 따라 산정된다.
- •조세특례제한법 제97조의3의 요건을 충족해야 한다.
- •장기일반민간임대주택의 양도 시 특별공제율이 적용된다.
쟁점사항
- •조세특례제한법 제97조의3의 적용 여부
- •임대기간 중 발생한 양도차익의 범위 여부
- •장기일반민간임대주택의 요건 충족 여부
관련 법령 및 판례·예규